هدف کلی:
گروه علمی پژوهش فرهنگستان علوم پزشکی جمهوری اسلامی ایران با هدف ارتقاء پژوهش‌های فرهنگستان علوم پزشکی و در راستای کمک به حل مشکلات حوزه سلامت کشور فعالیت می‌کند. 

اهداف اختصاصی: 
۱. مشارکت در رصد سیاست‌ها، برنامه‌ها و وضعیت تحقیقاتی کشور با ارائه مشاوره، نظریه‌پردازی و آینده‌نگری
۲. پیشنهاد و تعیین اولویت‌های تحقیقاتی بر اساس برنامه‌های راهبردی فرهنگستان 
۳. ارزیابی و تصویب طرح‌ها و فعالیت‌های پژوهشی 
۴. پایش و ارزشیابی طرح‌ها و فعالیت‌های پژوهشی
۵. تقویت یکپارچگی فعالیت‌های علمی و پژوهشی گروه‌های علمی فرهنگستان 
۶. ارتقاء اثربخشی و کارآیی فعالیت‌های علمی و پژوهشی گروه‌های علمی فرهنگستان 
۷. تقویت بهره‌برداری از دستاوردهای علمی و پژوهشی گروه‌های علمی فرهنگستان 

وظایف:
 ۱. ایجاد هماهنگی و یکپارچگی بین فعالیت‌های پژوهشی گروه‌های علمی فرهنگستان 
۲. مشاوره و همکاری با گروه‌های علمی فرهنگستان در مورد برنامه‌های راهبردی
۳. بررسی و پیشنهاد اصلاح برای طرح‌های پژوهشی گروه‌های علمی فرهنگستان 
۴. نظارت بر اجرای پژوهش‌ها و ترجمان دانش و کاربست حاصله و ارائه گزارش دوره ای
۵. مشارکت در اجرای سیستم مدیریت دانش در فرهنگستان 
۶. تشویق و ترغیب پژوهشگران به نوآوری و خلق آثار علمی‌کاربردی از طریق معرفی به معاونت علمی فرهنگستان 
۷. پیشنهاد برگزاری کارگاه‌ها، نشست‌ها و سمینارهای آموزشی در زمینه پژوهش به‌منظور انتقال و توسعه دانش پژوهش
۸. تعیین شاخص‌های ارزیابی سطوح پژوهش مورد وثوق فرهنگستان 
۹. همکاری در بررسی، نظارت و ارزیابی تألیف کتب با نام فرهنگستان 
۱۰. همکاری در ارزیابی و ارزشیابی فعالیت‌های پژوهشی محققین، به‌منظور معرفی دانشمندان و پژوهشگران برتر سال
۱1. مشاوره به نهادهای بالادستی و وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی (لایه‌های سیاست‌گذاری و نظارتی) برای تحکیم حکمرانی پژوهش سلامت
12. ارتباط و همکاری با مراکز پژوهشی، دانشگاه ها و نهادهای سلامت
13. مشارکت در تدوین برنامه راهبردی پژوهشی متناسب با اهداف فرهنگستان